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<link REL ="stylesheet" TYPE="text/css" HREF="../../marvinmanuals.css" TITLE="Style">
<title>Shapely color scheme in Marvin</title>
</head>
<body>

<h1>The shapely color scheme in Marvin</h1>
<p>

This color scheme is based on RasMol's shapely color scheme for nucleic and
amino acids. There are two main differences:
<ol>
<li>colors are web-optimized</li>
<li>some colors are darker in case of light background</li>
</ol>

<p>

<table CELLSPACING=0 CELLPADDING=5 border="0">
<tr><td>

<table CELLSPACING=0 CELLPADDING=5 border="0">
<tr><td ALIGN=RIGHT>0</td><td ALIGN=RIGHT><code>UNK</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff00ff">medium purple</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff00ff"><code>#ff00ff</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#990099"><code>#990099</code></font></td>
    </tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>1-2</td><td ALIGN=RIGHT><code>A, +A</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#9999ff">light blue</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#9999ff"><code>#9999ff</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#333399"><code>#333399</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>3-4</td><td ALIGN=RIGHT><code>C, +C</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff9933">light orange</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff9933"><code>#ff9933</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#996600"><code>#996600</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>5-6</td><td ALIGN=RIGHT><code>G, +G</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff6666">medium salmon</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff6666"><code>#ff6666</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#993333"><code>#993333</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>7-8</td><td ALIGN=RIGHT><code>T, +T</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#33ff33">light green</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#33ff33"><code>#33ff33</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#33ff33"><code>#33ff33</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>9-10</td><td ALIGN=RIGHT><code>I, +I</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff00ff">medium purple</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff00ff"><code>#ff00ff</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#990099"><code>#990099</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>11-12</td><td ALIGN=RIGHT><code>U, +U</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff00ff">medium purple</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff00ff"><code>#ff00ff</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#990099"><code>#990099</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>13</td><td ALIGN=RIGHT><code>ALA</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#99ff99">medium green</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#99ff99"><code>#99ff99</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#66cc66"><code>#66cc66</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>14</td><td ALIGN=RIGHT><code>ARG</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#0000ff">blue</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#0000ff"><code>#0000ff</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#0000ff"><code>#0000ff</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>15</td><td ALIGN=RIGHT><code>ASN</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff6666">light salmon</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff6666"><code>#ff6666</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#993333"><code>#993333</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>16</td><td ALIGN=RIGHT><code>ASP</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#990033">dark rose</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#990033"><code>#990033</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#990033"><code>#990033</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>17</td><td ALIGN=RIGHT><code>CYS</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ffff66">medium yellow</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ffff66"><code>#ffff66</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#666633"><code>#666633</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>18</td><td ALIGN=RIGHT><code>GLN</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff3333">dark salmon</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff3333"><code>#ff3333</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#cc3333"><code>#cc3333</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>19</td><td ALIGN=RIGHT><code>GLU</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#660000">dark brown</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#660000"><code>#660000</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#660000"><code>#660000</code></font></td></tr>
</table>

</td><td>

<table CELLSPACING=0 CELLPADDING=5 border="0">
<tr><td ALIGN=RIGHT>20</td><td ALIGN=RIGHT><code>GLY</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ffffff">white</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ffffff"><code>#ffffff</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#000000"><code>#000000</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>21</td><td ALIGN=RIGHT><code>HIS</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#6666ff">medium blue</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#6666ff"><code>#6666ff</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#6666cc"><code>#6666cc</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>22</td><td ALIGN=RIGHT><code>ILE</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#006600">dark green</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#006600"><code>#006600</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#006600"><code>#006600</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>23</td><td ALIGN=RIGHT><code>LEU</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#336633">olive green</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#336633"><code>#336633</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#336633"><code>#336633</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>24</td><td ALIGN=RIGHT><code>LYS</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#3333cc">royal blue</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#3333cc"><code>#3333cc</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#3333cc"><code>#3333cc</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>25</td><td ALIGN=RIGHT><code>MET</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#cc9933">light brown</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#cc9933"><code>#cc9933</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#cc9933"><code>#cc9933</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>26</td><td ALIGN=RIGHT><code>PHE</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#666633">olive gray</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#666633"><code>#666633</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#666633"><code>#666633</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>27</td><td ALIGN=RIGHT><code>PRO</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#666666">dark gray</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#666666"><code>#666666</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#666666"><code>#666666</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>28</td><td ALIGN=RIGHT><code>SER</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff6633">medium orange</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff6633"><code>#ff6633</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#ff6633"><code>#ff6633</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>29</td><td ALIGN=RIGHT><code>THR</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#cc3300">dark orange</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#cc3300"><code>#cc3300</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#cc3300"><code>#cc3300</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>30</td><td ALIGN=RIGHT><code>TRP</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#666600">olive brown</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#666600"><code>#666600</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#666600"><code>#666600</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>31</td><td ALIGN=RIGHT><code>TYR</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#996633">medium brown</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#996633"><code>#996633</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#996633"><code>#996633</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>32</td><td ALIGN=RIGHT><code>VAL</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff99ff">light purple</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff99ff"><code>#ff99ff</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#ff99ff"><code>#ff99ff</code></font></td></tr>
<tr><td ALIGN=RIGHT>33-34</td><td ALIGN=RIGHT><code>ASX, GLX</code></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff00ff">medium purple</font></td>
    <td BGCOLOR="#000000"><font COLOR="#ff00ff"><code>#ff00ff</code></font></td>
    <td BGCOLOR="#ffffff"><font COLOR="#990099"><code>#990099</code></font></td></tr>
</table>

</td></tr>
</table>

</body>
</html>
